Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TMEM135-204ENST00000526733 496 ntTSL 217.17■□□□□ 0.346e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TMEM135-203ENST00000525018 753 ntTSL 58.59□□□□□ -1.036e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.216e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.276e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TMEM135-206ENST00000529023 1095 ntTSL 25.82□□□□□ -1.486e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 518.66■□□□□ 0.581e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 59.29□□□□□ -0.922e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.255e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.235e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.325e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-205ENST00000573075 556 ntTSL 412.79□□□□□ -0.365e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-217ENST00000609442 555 ntTSL 312.61□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-207ENST00000574016 557 ntTSL 412.24□□□□□ -0.455e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-213ENST00000608198 578 ntTSL 512.02□□□□□ -0.495e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.515e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-219ENST00000610106 450 ntTSL 511.85□□□□□ -0.515e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-209ENST00000575626 624 ntTSL 311.85□□□□□ -0.515e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-203ENST00000571091 525 ntTSL 211.64□□□□□ -0.555e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-218ENST00000609990 610 ntTSL 511.64□□□□□ -0.555e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-210ENST00000576489 648 ntTSL 411.33□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-214ENST00000608245 465 ntTSL 511.33□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-215ENST00000608913 570 ntTSL 511.33□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-216ENST00000609398 584 ntTSL 511.33□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-211ENST00000576749 754 ntTSL 211.1□□□□□ -0.635e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MIR22HG-202ENST00000570416 535 ntTSL 37□□□□□ -1.295e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-217ENST00000534699 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-215ENST00000533818 552 ntTSL 49.91□□□□□ -0.825e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.025e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.185e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.225e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.35e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.315e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.475e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-212ENST00000529046 571 ntTSL 45.05□□□□□ -1.65e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-210ENST00000525878 626 ntTSL 44.8□□□□□ -1.645e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-211ENST00000525970 503 ntTSL 44.54□□□□□ -1.685e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-208ENST00000524652 562 ntTSL 43.21□□□□□ -1.95e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CSDE1-209ENST00000525132 521 ntTSL 52.95□□□□□ -1.945e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 MCF2L-218ENST00000442625 2710 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.039e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ASPHD1-204ENST00000563177 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.25■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 LCAT-204ENST00000570980 1240 ntTSL 218.02■□□□□ 0.481e-9■■■■□ 22.3
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PRPF4O43172 ZC3HC1-205ENST00000470651 567 ntTSL 413.61□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZC3HC1-203ENST00000360708 1676 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZC3HC1-209ENST00000481503 1741 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZC3HC1-201ENST00000311873 2017 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZC3HC1-204ENST00000467642 1934 ntTSL 210.04□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZC3HC1-206ENST00000471022 978 ntTSL 59.13□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZC3HC1-208ENST00000480193 563 ntTSL 38.39□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 22.3
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PRPF4O43172 ERBB2-222ENST00000584908 1316 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 22.3
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PRPF4O43172 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.344e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.124e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.054e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 BANP-221ENST00000497491 739 ntTSL 514.56□□□□□ -0.084e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.118e-8■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 518.39■□□□□ 0.538e-8■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.673e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 DUS1L-211ENST00000578907 1084 ntTSL 326.44■■□□□ 1.821e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 DUS1L-215ENST00000582529 1212 ntTSL 525.11■■□□□ 1.611e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 DUS1L-207ENST00000578176 937 ntTSL 524.46■■□□□ 1.511e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 DUS1L-208ENST00000578264 1071 ntTSL 516.09■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-8■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZNF514-203ENST00000447814 554 ntTSL 49.03□□□□□ -0.964e-8■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.891e-6■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ARFGAP1-219ENST00000524192 980 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-20■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 ARFGAP1-223ENST00000550188 572 ntTSL 511.39□□□□□ -0.592e-20■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.249e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.899e-7■■■■□ 22.3
PRPF4O43172 PLEKHJ1-202ENST00000585423 494 ntTSL 225.38■■□□□ 1.653e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-203ENST00000586497 573 ntTSL 324.79■■□□□ 1.563e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.543e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.333e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-207ENST00000588356 610 ntTSL 423.22■■□□□ 1.313e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.063e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.053e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.683e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-208ENST00000588450 2858 ntTSL 218.52■□□□□ 0.563e-7■■■■□ 22.2
PRPF4O43172 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.423e-7■■■■□ 22.2
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