Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
VGFO15240 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VGFO15240 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VGFO15240 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VGFO15240 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VGFO15240 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VGFO15240 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
VGFO15240 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
VGFO15240 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VGFO15240 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VGFO15240 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VGFO15240 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VGFO15240 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VGFO15240 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VGFO15240 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VGFO15240 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VGFO15240 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VGFO15240 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VGFO15240 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VGFO15240 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VGFO15240 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VGFO15240 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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