Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1O00291 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1O00291 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1O00291 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1O00291 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIP1O00291 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIP1O00291 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIP1O00291 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIP1O00291 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIP1O00291 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIP1O00291 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIP1O00291 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIP1O00291 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIP1O00291 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIP1O00291 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms