Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms