Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN25C9JDP6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms