Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85CA6NKD9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms