Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00862A6NCI5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00862A6NCI5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms