Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms