Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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