Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N8

CDH10, Cadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH10Q9Y6N8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH10Q9Y6N8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH10Q9Y6N8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH10Q9Y6N8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH10Q9Y6N8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH10Q9Y6N8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH10Q9Y6N8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms