Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Y9

LSM5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM5Q9Y4Y9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM5Q9Y4Y9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LSM5Q9Y4Y9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LSM5Q9Y4Y9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM5Q9Y4Y9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms