Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
DCAF1Q9Y4B6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.66■■■■■ 6.02
DCAF1Q9Y4B6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC52.66■■■■■ 6.02
DCAF1Q9Y4B6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC52.65■■■■■ 6.02
DCAF1Q9Y4B6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC52.64■■■■■ 6.02
DCAF1Q9Y4B6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC52.63■■■■■ 6.02
DCAF1Q9Y4B6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC52.62■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC52.62■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC52.58■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC52.57■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.57■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC52.57■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC52.57■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.57■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC52.56■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC52.56■■■■■ 6.01
DCAF1Q9Y4B6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
DCAF1Q9Y4B6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
DCAF1Q9Y4B6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
DCAF1Q9Y4B6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.54■■■■■ 6
DCAF1Q9Y4B6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.53■■■■■ 6
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
DCAF1Q9Y4B6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC52.5■■■■■ 6
DCAF1Q9Y4B6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC52.5■■■■■ 6
DCAF1Q9Y4B6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC52.49■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC52.47■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC52.45■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.45■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC52.44■■■■■ 5.99
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC52.43■■■■■ 5.98
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC52.43■■■■■ 5.98
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC52.43■■■■■ 5.98
DCAF1Q9Y4B6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
DCAF1Q9Y4B6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
DCAF1Q9Y4B6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC52.39■■■■■ 5.98
DCAF1Q9Y4B6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
DCAF1Q9Y4B6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC52.36■■■■■ 5.97
DCAF1Q9Y4B6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.33■■■■■ 5.97
DCAF1Q9Y4B6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
DCAF1Q9Y4B6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC52.32■■■■■ 5.97
DCAF1Q9Y4B6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC52.31■■■■■ 5.96
DCAF1Q9Y4B6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
DCAF1Q9Y4B6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
DCAF1Q9Y4B6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
DCAF1Q9Y4B6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
DCAF1Q9Y4B6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.3■■■■■ 5.96
DCAF1Q9Y4B6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC52.3■■■■■ 5.96
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
DCAF1Q9Y4B6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC52.25■■■■■ 5.95
DCAF1Q9Y4B6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.25■■■■■ 5.95
DCAF1Q9Y4B6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.24■■■■■ 5.95
DCAF1Q9Y4B6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC52.24■■■■■ 5.95
DCAF1Q9Y4B6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.24■■■■■ 5.95
DCAF1Q9Y4B6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.2■■■■■ 5.95
DCAF1Q9Y4B6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC52.2■■■■■ 5.95
DCAF1Q9Y4B6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.19■■■■■ 5.94
DCAF1Q9Y4B6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
DCAF1Q9Y4B6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC52.14■■■■■ 5.94
DCAF1Q9Y4B6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
DCAF1Q9Y4B6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC52.12■■■■■ 5.93
DCAF1Q9Y4B6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
DCAF1Q9Y4B6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
DCAF1Q9Y4B6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
DCAF1Q9Y4B6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
DCAF1Q9Y4B6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC52.09■■■■■ 5.93
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.07■■■■■ 5.93
DCAF1Q9Y4B6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
DCAF1Q9Y4B6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
DCAF1Q9Y4B6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
DCAF1Q9Y4B6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
DCAF1Q9Y4B6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC52.01■■■■■ 5.92
DCAF1Q9Y4B6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.92
DCAF1Q9Y4B6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.95■■■■■ 5.91
DCAF1Q9Y4B6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC51.94■■■■■ 5.9
DCAF1Q9Y4B6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.93■■■■■ 5.9
DCAF1Q9Y4B6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC51.93■■■■■ 5.9
DCAF1Q9Y4B6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
DCAF1Q9Y4B6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
DCAF1Q9Y4B6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.88■■■■■ 5.9
DCAF1Q9Y4B6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC51.85■■■■■ 5.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms