Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFE2L3Q9Y4A8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFE2L3Q9Y4A8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFE2L3Q9Y4A8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFE2L3Q9Y4A8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFE2L3Q9Y4A8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFE2L3Q9Y4A8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NFE2L3Q9Y4A8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFE2L3Q9Y4A8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NFE2L3Q9Y4A8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFE2L3Q9Y4A8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFE2L3Q9Y4A8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms