Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIF3AQ9Y496 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIF3AQ9Y496 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIF3AQ9Y496 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIF3AQ9Y496 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIF3AQ9Y496 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIF3AQ9Y496 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms