Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF11Q9Y3C5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF11Q9Y3C5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF11Q9Y3C5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF11Q9Y3C5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF11Q9Y3C5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF11Q9Y3C5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF11Q9Y3C5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF11Q9Y3C5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF11Q9Y3C5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF11Q9Y3C5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF11Q9Y3C5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF11Q9Y3C5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms