Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3KQ9Y2Y1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3KQ9Y2Y1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3KQ9Y2Y1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms