Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIPT1Q9Y234 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIPT1Q9Y234 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIPT1Q9Y234 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPT1Q9Y234 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPT1Q9Y234 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms