Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP2BQ9UQN3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2BQ9UQN3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2BQ9UQN3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2BQ9UQN3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2BQ9UQN3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP2BQ9UQN3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP2BQ9UQN3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP2BQ9UQN3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP2BQ9UQN3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP2BQ9UQN3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2BQ9UQN3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2BQ9UQN3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2BQ9UQN3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP2BQ9UQN3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP2BQ9UQN3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP2BQ9UQN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP2BQ9UQN3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP2BQ9UQN3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP2BQ9UQN3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms