Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY5

SLC7A11, Cystine/glutamate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A11Q9UPY5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A11Q9UPY5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A11Q9UPY5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A11Q9UPY5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A11Q9UPY5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A11Q9UPY5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC7A11Q9UPY5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms