Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6BQ9UPQ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNRC6BQ9UPQ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNRC6BQ9UPQ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNRC6BQ9UPQ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms