Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNPO2Q9UMS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNPO2Q9UMS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SYNPO2Q9UMS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNPO2Q9UMS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNPO2Q9UMS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNPO2Q9UMS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNPO2Q9UMS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNPO2Q9UMS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNPO2Q9UMS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYNPO2Q9UMS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNPO2Q9UMS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SYNPO2Q9UMS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYNPO2Q9UMS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNPO2Q9UMS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNPO2Q9UMS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNPO2Q9UMS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNPO2Q9UMS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNPO2Q9UMS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYNPO2Q9UMS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYNPO2Q9UMS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNPO2Q9UMS6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms