Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPCAL4Q9UM19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPCAL4Q9UM19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPCAL4Q9UM19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HPCAL4Q9UM19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPCAL4Q9UM19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPCAL4Q9UM19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms