Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RCAN3Q9UKA8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RCAN3Q9UKA8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RCAN3Q9UKA8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RCAN3Q9UKA8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RCAN3Q9UKA8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RCAN3Q9UKA8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RCAN3Q9UKA8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
RCAN3Q9UKA8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RCAN3Q9UKA8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RCAN3Q9UKA8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RCAN3Q9UKA8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RCAN3Q9UKA8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RCAN3Q9UKA8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RCAN3Q9UKA8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RCAN3Q9UKA8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RCAN3Q9UKA8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RCAN3Q9UKA8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RCAN3Q9UKA8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RCAN3Q9UKA8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RCAN3Q9UKA8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RCAN3Q9UKA8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RCAN3Q9UKA8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RCAN3Q9UKA8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RCAN3Q9UKA8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RCAN3Q9UKA8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RCAN3Q9UKA8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RCAN3Q9UKA8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RCAN3Q9UKA8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms