Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms