Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL4Q9UKA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXL4Q9UKA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXL4Q9UKA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXL4Q9UKA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXL4Q9UKA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXL4Q9UKA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms