Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFA12Q9UI09 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDUFA12Q9UI09 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA12Q9UI09 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA12Q9UI09 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms