Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDRG3Q9UGV2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDRG3Q9UGV2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG3Q9UGV2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDRG3Q9UGV2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDRG3Q9UGV2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDRG3Q9UGV2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms