Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPSNAP3AQ9UFN0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms