Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REV1Q9UBZ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REV1Q9UBZ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
REV1Q9UBZ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REV1Q9UBZ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REV1Q9UBZ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REV1Q9UBZ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms