Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKLFQ9UBR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKLFQ9UBR5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKLFQ9UBR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKLFQ9UBR5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKLFQ9UBR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKLFQ9UBR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKLFQ9UBR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKLFQ9UBR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms