Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO1AQ9UBC5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO1AQ9UBC5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYO1AQ9UBC5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYO1AQ9UBC5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO1AQ9UBC5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms