Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD7Q9P2D1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHD7Q9P2D1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD7Q9P2D1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD7Q9P2D1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD7Q9P2D1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD7Q9P2D1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHD7Q9P2D1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHD7Q9P2D1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD7Q9P2D1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD7Q9P2D1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD7Q9P2D1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHD7Q9P2D1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD7Q9P2D1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHD7Q9P2D1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHD7Q9P2D1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHD7Q9P2D1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms