Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSRB1Q9NZV6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSRB1Q9NZV6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSRB1Q9NZV6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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