Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY37

ASIC5, Acid-sensing ion channel 5, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC5Q9NY37 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC5Q9NY37 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC5Q9NY37 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC5Q9NY37 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC5Q9NY37 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC5Q9NY37 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC5Q9NY37 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC5Q9NY37 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC5Q9NY37 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ASIC5Q9NY37 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC5Q9NY37 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC5Q9NY37 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC5Q9NY37 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC5Q9NY37 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC5Q9NY37 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC5Q9NY37 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC5Q9NY37 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC5Q9NY37 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC5Q9NY37 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC5Q9NY37 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ASIC5Q9NY37 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC5Q9NY37 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC5Q9NY37 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms