Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW07

ZNF358, Zinc finger protein 358, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358Q9NW07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF358Q9NW07 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF358Q9NW07 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF358Q9NW07 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF358Q9NW07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF358Q9NW07 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF358Q9NW07 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF358Q9NW07 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF358Q9NW07 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF358Q9NW07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF358Q9NW07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF358Q9NW07 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF358Q9NW07 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF358Q9NW07 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF358Q9NW07 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF358Q9NW07 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms