Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD3AQ9NVI7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD3AQ9NVI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD3AQ9NVI7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD3AQ9NVI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms