Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJB4Q9NTQ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GJB4Q9NTQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJB4Q9NTQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJB4Q9NTQ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GJB4Q9NTQ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJB4Q9NTQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJB4Q9NTQ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJB4Q9NTQ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJB4Q9NTQ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJB4Q9NTQ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms