Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA3Q9NST1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA3Q9NST1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA3Q9NST1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA3Q9NST1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms