Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RAD18Q9NS91 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD18Q9NS91 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD18Q9NS91 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD18Q9NS91 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD18Q9NS91 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms