Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
STRN4Q9NRL3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
STRN4Q9NRL3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRN4Q9NRL3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRN4Q9NRL3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
STRN4Q9NRL3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
STRN4Q9NRL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
STRN4Q9NRL3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
STRN4Q9NRL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
STRN4Q9NRL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
STRN4Q9NRL3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRN4Q9NRL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
STRN4Q9NRL3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
STRN4Q9NRL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRN4Q9NRL3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
STRN4Q9NRL3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRN4Q9NRL3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRN4Q9NRL3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
STRN4Q9NRL3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRN4Q9NRL3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRN4Q9NRL3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRN4Q9NRL3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRN4Q9NRL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
STRN4Q9NRL3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
STRN4Q9NRL3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
STRN4Q9NRL3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRN4Q9NRL3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRN4Q9NRL3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
STRN4Q9NRL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
STRN4Q9NRL3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms