Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SNRKQ9NRH2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNRKQ9NRH2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SNRKQ9NRH2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SNRKQ9NRH2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SNRKQ9NRH2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNRKQ9NRH2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SNRKQ9NRH2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms