Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS2Q9NRF8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTPS2Q9NRF8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS2Q9NRF8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms