Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPTBN5Q9NRC6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTBN5Q9NRC6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTBN5Q9NRC6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTBN5Q9NRC6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTBN5Q9NRC6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTBN5Q9NRC6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms