Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf4Q9NR00 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf4Q9NR00 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf4Q9NR00 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf4Q9NR00 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf4Q9NR00 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms