Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM8Q9NQV8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM8Q9NQV8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM8Q9NQV8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDM8Q9NQV8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms