Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM9Q9NQV7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM9Q9NQV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM9Q9NQV7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM9Q9NQV7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms