Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ66

PLCB1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB1Q9NQ66 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLCB1Q9NQ66 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLCB1Q9NQ66 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLCB1Q9NQ66 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLCB1Q9NQ66 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLCB1Q9NQ66 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB1Q9NQ66 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PLCB1Q9NQ66 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms