Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBN1Q9NPG3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UBN1Q9NPG3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
UBN1Q9NPG3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBN1Q9NPG3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBN1Q9NPG3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBN1Q9NPG3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms