Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP25Q9NPA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP25Q9NPA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP25Q9NPA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP25Q9NPA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP25Q9NPA2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms