Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK6Q9HC98 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEK6Q9HC98 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK6Q9HC98 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK6Q9HC98 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK6Q9HC98 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms