Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTN4Q9HB63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTN4Q9HB63 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTN4Q9HB63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTN4Q9HB63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTN4Q9HB63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms